基于ceRNA调控网络的乳腺癌预后相关生物标志物筛选

目的 利用肿瘤基因组图谱(TCGA)数据库筛选差异表达mRNA、miRNA和lncRNA分子标签,构建预后相关的核心ceRC188-9购买NA调控子网络,探索其在乳腺癌预后相关生物标志物筛选中的作用。方法 从TCGA下载乳腺癌患者的测序数据和临床数据,利用R包“Deseq2”和单因素C抑制剂OX比例风险回归模型,分别筛选差异表达且与预后相关的mRNA、miRNA和lncRNA分子标签,基于预测性数据库构建ceRNA网络,并对网络中的核心mRNA进行功能注释和免疫相关性分析。结果 筛选出3个mRNA(KLF11、EDA、STXBP1)、1个lncRNA(XIST)和2个miRNA(hsa-miR-130a-3p、hsa-miR-195-5p)组成的核心ceRNA子网络,生存分析显示miRNA低表达、mRNA和lncRNA高表达,总生存期显著降低。结论 核心ceRNA子网络中的6个RNA相互调OTX015细胞系节,可能通过免疫系统在乳腺癌发生发展中起重要作用,对预后产生影响。

Leave a Reply

Your email address will not be published. Required fields are marked *

*

You may use these HTML tags and attributes: <a href="" title=""> <abbr title=""> <acronym title=""> <b> <blockquote cite=""> <cite> <code> <del datetime=""> <em> <i> <q cite=""> <strike> <strong>