本研究利用水稻基因组插入缺失(InsertionDeletion, ID)位点开发了9个ID标记用以鉴定生产中常用的29份杂交稻骨干亲本。利用标记电泳图谱做了供试材料的聚类分析,在遗传相似系数0.55左右可将所有供试材料分为5个类群,另外根据不同的亲缘关系和来源地区,又可以将供试材料分为9个亚群。最后利用品种鉴别标记和生长测试两种方法对一份杂交稻种子广两优476纯度Caspase inhibition进行了检测,结果表明两者基本一致。因此,分子标记可以有效应用于现代育种的各个环节,从而加快新品种选育。研究结果将为水稻育种、新品种审定、品种鉴定以及种子生产提供参考。
为了初步了解贵州省规模化猪场健康仔猪携带病毒的病原本底,本研究在贵州4个地点的猪场采集了151头健康仔猪的咽拭子和肛拭子。病毒宏基因组学分析显示这些仔猪共携带25个科的AMN-107订单病毒,包括噬菌体、昆虫病毒、脊椎动物病毒等。在脊椎动物相关的病毒科中,其中四个猪场共同存在星状病毒、冠状病毒、微小核糖核酸病毒等11个病毒科。此外,在每个猪场中,疱疹病毒、黄病毒在咽拭子中的reads数均大于肛拭子中的reads;圆环病毒、呼肠弧病毒、微小核糖核酸病毒、星状病毒、冠状病毒在肛拭子中的reads数均大于咽拭子中的reads数,PCI-32765半抑制浓度提示这些病毒的组织嗜性。对猪瘟病毒、类圆环病毒、博卡细小病毒、星状病毒、萨佩罗病毒的contigs进行进化分析,结果发现星状病毒具有丰富的遗传多样性,而其他病毒与各自参考毒株进化关系较近;猪类圆环病毒与牛类圆环病毒核苷酸同源性很高,提示跨种传播或基因重组。我们对突隆病毒进行了检测,发现其广泛分布于四个猪场健康仔猪的咽拭子和肛拭子,阳性率为75%-100%。本研究为健康仔猪携带病毒的多样性和本底情况提供了重要的基础数据。