设计了子结构差异核函数、子结构对核函数、匹配分子对核函数等新核函数。利用设计的新核函数,9个数据集的活性极化匹配分子对预测的平均真阳性率和F-score分别为86.2%和84.3%,平均精度和准确率分别为82.9%和95.8%。本研究中活性极化匹配分子对的预测是活性极化研究方面的首例。 综上所述,本论文利用化学信息学方法对化合物的生物活购买抑制剂性和毒性进行了计算研究。以上四个方面的研究均得到了良好的结果。
第一章：在美国男性中，前列腺癌（Prostate cancer, PCa）是第二高发病率的肿瘤同时也是致死率第二高的肿瘤。以雄激素受体（Androgen receptor, AR）为靶标的去势疗法会导致病人发展出去势抵抗型前列腺癌（Castrat获悉更多ion-resistantPCa，CRPC），而治疗去势抵抗型前列腺癌的化学疗法又会导致更恶性的化疗抵抗型前列腺癌（Chemo-resistant prostate cancer），但是在这些复发型或难治型前列腺癌中，普遍存在配体结合结构域（ligand binding domain, LBD）缺失的雄激素受体Ibrutinib剪接变异体（Androgen receptor splicing variants, ARVs）的表达。在临床数据中表明，AR-V7和ARV567es在ARVs中的表达量占绝大多数，所以研究AR-V7和ARV567es与前列腺癌之间的关系具有非常重大的意义。 我们在雄激素存在和雄激素耗尽两种条件下，对比了AR和ARVs功能的不同，例如转录活性，下游基因的表达，以及对前列腺癌细胞的生长促进等。