序列比对发现,两株病毒共存在12个核苷酸的差异,导致6个氨基酸的差异,分别为VP1区K98E(全编码区为K663E)和A133T(A698T)以及2C区D48N(D1159N)、V126I(V1237I)、I238V(I1349V)和N314Y(N1425Y)。结论 SDJN2015-01和SDJN2015-01.购买LDK3781株同属EV71C4a亚型,其与C4a亚型标准株EU703813具有高度同源性;两株病毒间在VP1和2C区产生的氨基酸的变异对病毒毒力以及感染能力是否有影响有待进一步研究。
目的了解北京市顺义区急性胃肠炎成年患者中诺如病毒的感染规律及其基因特征。方法采集2014年1月至20Selleck15年12月份北京市顺义区肠道门诊急性胃肠炎成年患者的粪便标本240份,并收集患者的流行病学资料。标本进行诺如病毒实时荧光定量PCR(Real-time PCR)检测,阳性标本应用逆转录PCR(Reverse transcription-PCR,RT-PCR)扩增诺如病毒RNA依赖性RNA时间聚合酶基因(RNA-dependent RNA polymerase,RdRp),并进行序列测定和基因分析。结果诺如病毒阳性检出率23.33%(56/240),以GⅡ群为主(20.83%,50/240),GⅠ群次之(2.50%,6/240);男女阳性检出率无统计学差异(χ~2=0.21,P=0.65);2014-2015全年均有诺如病毒检出,高峰在11月份至次年3月份。